农村合作社股东退出需遵循法定程序。依据《中华人民共和国公司法》，股东可相互转让股权，需经法定代表人同意，并提交相关文件如股东决议、股权转让协议等。未及时处理可能导致股权纠纷，影响合作社运营。
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股东退出流程：1.内部转让：与意向股东协商，达成股权转让协议，经法定代表人签署同意。2.外部转让：除内部转让步骤外，还需提交新股东主体资格证明，经合作社审核。3.提交材料：准备企业申请变更登记委托书、身份证明、股东决议等文件。4.办理变更：携带所有材料至工商部门，办理股东变更登记，确保合法退出。
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农村合作社股东退出常见方式为股权转让。选择时，应考虑合作社章程规定、股东会决议及股权转让协议的合法性。若向外部转让，还需确认新股东资格，确保流程合规。